Флора та Фауна

Схили каньйону, складені світло-сірими та рожевими вапняками, місцями порослі невеликими групами кримських сероствольных сосен. У нижній частині ущелини ростуть широколистяні ліси. Основні породи дерев — граб, бук, ясен, дуб, польовий клен, горобина, липа. Підлісок складається з чагарників: ліщина, кизилу, барбарису, крушини, скумпії, грабинника, у великій кількості представлений плющ звичайний . Особливістю флори каньйону є наявність понад півтори тисячі дерев третинного релікту — тиса ягідного . Старі тиси досягають 1.5 метра в обхваті і 10-15 метрів висоти. Крім того, в каньйоні ростуть рідкісні види папоротей, реліктова рускус під'язиковий, ендемічна ломикамінь, більше двох третин видів орхідей Криму, серед яких дуже рідкісна орхідея Венерин черевичок і інші рослини.

З фауни Великого каньйону найбільш примітним видом є струмкова форель, яка мешкає в холодній, насиченою киснем, воді річок ущелини. З ссавців часто зустрічається їжак, рідше кримський вид ласки, кримський підвид борсука, козуля. З птахів найбільш характерні: кримська московка, довгохвоста синиця, дятел, горихвістка, малинівка, вівчарик і сойка. З рептилій найбільш численні ящірки.

Русло каньйону являє собою западину з гладкими стінами по бортах, з нагромадженнями брил і валунів на дні, з порогами (тобто виходами твердіших гірських порід), водоспадами до 3—4 м заввишки і з ерозійними котлами (так званими ваннами) завглибшки до 2,5 м, завширшки в обидва борти і завдовжки до 10 м. Утворилися в результаті дії водної ерозії. Усього в каньйоні налічується більше 150 подібних котлів.

Каньйон зрошують численні гірські потоки, струмки і джерела (найбільший з них — Панія, має середньорічну витрату води 350 літрів в секунду), які на виході з ущелини зливаються в річку Аузун-Узень (крим. Гирлова або Ротова ріка). Температура води в річці та її притоках ніколи не перевищує +11 °C. Від злиття річок Аузун-Узень і Сари-Узень утворюється річка Коккозка, що є лівою притокою найбагатоводнішої річки Криму — Бельбеку. Тільки в період другої половини літа і восени, коли випадає мало опадів, каньйон стає майже сухим і доступнішим для огляду. У дощ перебувати в каньйоні небезпечно через посилення каменепадів. З цієї ж причини і в суху погоду небезпечно підходити до стін каньйону. Після багатогодинних дощів руслом мчить руйнівний водяний потік, що змітає на своєму шляху важкі валуни.

У Великому каньйоні Криму особливий мікроклімат, що сформувався завдяки його геоморфологічним особливостям і розташуванню. Відмітною рисою мікроклімату каньйону є вищий рівень вологості і нижчий рівень температур, у порівнянні з навколишньою територією. Рослинність тут розвивається із запізненням на 3—4 тижні в порівнянні з навколишніми лісами. Але в льодовикову епоху, добре ізольований каньйон став притулком для багатьох теплолюбних рослин.